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Genetic and Epigenetic Characteristics of Inflammatory Bowel Disease-Associated Colorectal Cancer.
2021
doi: 10.1053/j.gastro.2021.04.042 Background & Aims Inflammatory bowel disease (IBD) is a chronic, relapsing inflammatory disorder associated with an elevated risk of colorectal cancer (CRC). IBD-associated CRC (IBD-CRC) may represent a distinct pathway of tumorigenesis compared to sporadic CRC (sCRC). Our aim was to comprehensively characterize IBD-associated tumorigenesis integrating multiple high-throughput approaches, and to compare the results with in-house data sets from sCRCs. Methods Whole-genome sequencing, single nucleotide polymorphism arrays, RNA sequencing, genome-wide methylation analysis, and immunohistochemistry were performed using fresh-frozen and formalin-fixed tissue sam…
Variabilità spaziale dell'orizzonte gypsico in un ambiente mediterraneo semiarido della Sicilia centro meridionale
2004
Nell’ambiente semiarido della Sicilia centro meridionale vi sono suoli che pur non evolvendo direttamente su substrati gessosi risultano interessati dall’accumulo di gesso secondario. Scopo di questo lavoro è evidenziare le caratteristiche e la distribuzione spaziale dell’orizzonte gypsico proprio di suoli che evolvono su un substrato privo di gesso ma che sono da classificare come Gypsisuoli. È stata scelta un area costituita da un pendio collinare ad andamento Nord-Ovest Sud-Est in cui sono presenti suoli che evolvono su marne argillose del Pliocene inferiore “trubi” e poste a quota topograficamente più bassa rispetto ad un affioramento gessoso del Messiniano. Lungo la pendice sono stati …
Somatic mutation profiles as molecular classifiers of ulcerative colitis-associated colorectal cancer.
2021
Ulcerative colitis increases colorectal cancer risk by mechanisms that remain incompletely understood. We approached this question by determining the genetic and epigenetic profiles of colitis-associated colorectal carcinomas (CA-CRC). The findings were compared to Lynch syndrome (LS), a different form of cancer predisposition that shares the importance of immunological factors in tumorigenesis. CA-CRCs (n=27) were investigated for microsatellite instability, CpG island methylator phenotype, and somatic mutations of 999 cancer-relevant genes ("Pan-cancer" panel). A subpanel of "Pan-cancer" design (578 genes) was used for LS colorectal tumors (n=28). Mutational loads and signatures stratifie…
Gestione dell’irrigazione con acque salmastre ed evoluzione della salinita’ dei suoli in un versante sito in agro di Castelvetrano (Trapani-Sicilia).
2010
Clay minerals, oxyhydroxide formation, element leaching and humus development in volcanic soils
2008
Aweathering sequence with soils developing on volcanic, trachy-basaltic parent materials with ages ranging from 100–115,000 years in the Etna region served as the basis to analyse and calculate the accumulation and stabilisation mechanisms of soil organic matter (SOM), the transformation of pedogenic Fe and Al, the formation and transformation of clay minerals, the weathering indices and, by means of mass-balance calculations, net losses of the main elements. Although the soils were influenced by ash depositions during their development and the soil on the oldest lava flow developed to a great extent under a different climate, leaching of elements and mineral formation and transformation co…
Effetti della concimazione fogliare con urea e con estratti proteici sui descrittori fisici, chimicie biochimici della qualità di un suolo vulcanico …
2005
La produttività di una coltura e la qualità delle produzioni sono strettamente correlate alla disponibilità dei nutrienti nel suolo. In passato, la concimazione era vista quasi esclusivamente come mezzo per massimizzare le produzioni unitarie delle colture mentre venivano trascurati alcuni aspetti, oggi divenuti fondamentali come, per esempio, il mantenimento di ottimi livelli di fertilità del terreno in assenza di rischi di inquinamento ambientale. La valutazione della fertilità complessiva di un suolo e della relativa qualità è, pertanto divenuto, uno dei principali fattori ai fini dello sviluppo di modelli colturali a basso impatto ambientale. Nella presente nota si riferisce dei primi r…
SIMBIONTI RADICALI DI ASTRAGALUS NEBRODENSIS (GUSS.) STROBL.
2013
Le leguminose spontanee mediterranee hanno un elevato potenziale nei processi di rinaturalizzazione di ecosistemi degradati o semiaridi poiché stabiliscono simbiosi radicali con batteri azoto-fissatori e funghi micorrizici i quali, agendo sinergicamente, avvantaggiano la pianta per la nutrizione e la resistenza agli stress. Astragalus nebrodensis è un arbusto perenne appartenente alla famiglia delle Fabaceae, endemico in Sicilia; i simbionti radicali di questa specie non sono noti. Gli obiettivi di questo studio sono stati: 1) l’analisi della diversità dei rizobi simbionti di Astragalus nebrodensis; 2) la valutazione dell’effetto dell’inoculo di rizobi da collezione e di funghi micorrizici …